Bereiche | Tage | Auswahl | Suche | Aktualisierungen | Downloads | Hilfe
BP: Fachverband Biologische Physik
BP 10: Posters: Molecular Motors
BP 10.10: Poster
Dienstag, 1. April 2014, 09:30–12:30, P1
Rotation eines Proteinkomplexes in einer Lipidmembran: Molekulardynamik-Simulationen — •Michael Becker — Universität Duisburg-Essen 47057 Duisburg
Wir befassen uns mit der Simulation des F0c-Unterkomplexes der ATP Synthase und dessen Interaktion mit den Membranlipiden bei der Rotation. Zu diesem Zweck wird eine MD Simulation, bestehend aus einer Membran und des in ihr eingebetteten c-Ringes durchgeführt. Die Rotation des c-Ringes wird mittels einer gesteuerten Molecular Dynamik Simulation realisiert, wobei die Geschwindigkeit und somit der Impuls der Atome des c-Ringes alle 0.1 [ps] angepasst wird. Das hieraus resultierende Drehmoment ist durch M→=r→ × ∂ P→/∂ t gegeben. Unsere Idee ist es also, dem c-Ring alle 0.1 [ps] einen festen Drehimpuls L→ zu geben und anhand der Änderung dieses Drehimpulses, in der Zeit von eben diesen 0.1 [ps], dass durch die Reibung wirkende Drehmoment mittels M→=L→(t)−L→(t0)/Δ t zu bestimmen, da im Gleichgewicht dieses Drehmoment dem angelegten entspricht.