Dresden 2003 – wissenschaftliches Programm

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CPP: Chemische Physik und Polymerphysik

CPP 3: Biomoleküle

CPP 3.4: Vortrag

Montag, 24. März 2003, 11:00–11:15, ZEU/118

Untersuchung möglicher Ubiquinon-Pfade aus dem Reaktionszentrum mittels MD-Simulation — •Andrew Aird¹, Carsten Tietz¹, Daniel Pflugfelder¹, Jörg Wrachtrup¹, Felix Authenrieth² und Klaus Schulten² — ¹3. Physikalisches Institut, Universität Stuttgart — ²Theoretical Biophysics Group, University of Illinois at Urbana-Champaign

Der Kernkomplex der Photosyntheseeinheit des Purpurbakteriums Rhodospirillum rubrum wurde modelliert. Mittels Homologie-Modellierung wurden, ausgehend von der bekannten Struktur des Reaktionszentrums und der monomerischen Untereinheit des LH2-Komplexes der verwandten Spezies Rhodobacter sphaeroides, Modelle des Reaktionszentrums und des Lichtsammelkomplexes von R. rubrum erstellt.

Im Reaktionszentrum dient ein Ubiquinon als Elektronencarrier, um die beim Photosyntheseprozess entstehenden Elektronen aus dem Kernkomplex zum Cytochrom bc₁ Komplex zu transportieren. Hierbei ist der Weg des Ubiquinons aus dem LH1-Ring bis heute unbekannt. Mittels Steered Molecular Dynamics wurde ein denkbarer Weg simuliert und dabei getestet, inwieweit es dem Ubiquinon möglich ist, durch den vollständig geschlossenen Ring zu diffundieren.